Ikerketa institutuak eta ikastegiak ikerketa egiteko egitura zabalak dira, ikertzaileen komunikazioa, elkarren arteko harremana eta lan komuna errazteko sortuak. Helburutzat dute, aurrena, ezagutza sortzea, eta horretarako zentro hauen sorrera eta osaera eskakizun akademikoaren maila altuan oinarritzen dira, eta gero ezagutza hori eraginkorki pasaraztea gizarteari eta ekoizpen sektoreari.

Ikerketa Institutuak:

• Smart Cities Ikerketa Institutua (ISC)
• Material Aurreratuetarako eta Matematikarako Institutua (INAMAT2)
• Negozioei eta Ekonomiari buruzko Ikerketa Aurreratutako Institutua (INARBE)
• Nekazaritzako Elikagaien Katearen Berrikuntzarako eta Jasangarritasunerako Ikerketa Institutua (IS-FOOD)
• Gizarte Ikerketa Aurreraturako Institutua (I-COMMUNITAS)
• Biologia Aplikatuko Diziplina Anitzeko Ikerketa Institutua (IMAB)

Ikerketa Ikastegiak:

• Navarrabiomed. Ikerketa Biomedikoko Zentro mistoa.

Ikerketarako Itun estrategikoak:

• IDISNA. Nafarroako Osasun Ikerketarako Institutua.
• NAITEC. Mugikortasunean eta Mekatronikan espezializatutako Nafarroako Zentro Teknologikoa.