Desde un enfoque ecológico, buscamos dar una respuesta aplicada a los retos que plantea la gestión de estos ecosistemas ante un escenario de cambio global en áreas desfavorecidas y de montaña.  El papel del herbívoro en el mantenimiento de la diversidad y la función de estos ecosistemas, el rol de prácticas tradicionales como el fuego controlado en el ciclo de los nutrientes y los mecanismos de expansión rápida de especies ante regímenes de perturbación alterados por el cambio global son algunas de las líneas de trabajo del grupo.

Desde el Herbario UPNA se realizan labores de apoyo en muestreos e inventarios de hábitats forestales, determinación de especies y gestión de bases de datos y capas SIG de flora.

El grupo de Ecología y Medio Ambiente es el líder del proyecto COMPAS financiado por la Fundación Biodiversidad.