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El herbario UPNA alberga 10.316 pliegos correspondientes a 2.926 taxones, fundamentalmente de flora de Navarra. Se crea en 1997 con la incorporación del herbario del Departamento de Agricultura del Gobierno de Navarra.
En 2005 se establece como Servicio del Herbario, dependiente del Departamento de Ciencias del Medio Natural, con la dedicación específica de un conservador. Este Servicio realiza labores de apoyo a la docencia y a la investigación, difunde sus contenidos a través de los sitios web que elabora y aportando datos a Global Biodiversity Information Facility. Es miembro de la Asociación de Herbarios Ibérico-Macaronésicos.
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