Universidad Pública de Navarra - Nafarroako Univertsitate Publikoa

Metodología

M1. Método expositivo

M2. Resolución de ejercicios y problemas

M3. Aprendizaje basado en problemas/proyectos

Docencia centrada en el alumno en la que prima el aprendizaje activo. Las distintas actividades formativas se centran en el desarrollo de las competencias genéricas y específicas anteriormente descritas. La formación del estudiante será evaluada de acuerdo al tipo de docencia presencial de la titulación. 

Se imparten un total de 28 horas presenciales dedicadas a clases expositivas en el aula. Estas clases se dedican a impartir la parte teórica de la asignatura con la ayuda de un ordenador y un cañón de vídeo para la proyección de material en formato digital, y con la pizarra del aula.

Se imparten clases presenciales de contenido práctico en el laboratorio, hasta un total de 28 horas, en las que se desarrollarán actividades de programación con distintos algoritmos y estructuras de datos, y en las que se trabajará con distintos sistemas de cómputo para la realización de uno o varios proyectos prácticos y de problemas.

Actividad formativa	Nº Horas	Presencialidad (%)
A1- Clases expositivas/ participativas	28	100
A2. Prácticas	28	100
A4. Realización de trabajos/proyectos en grupo	42	0
A5. Estudio y trabajo autónomo del estudiante	47	0
A6. Tutorías	1	0
A7. Pruebas de evaluación	4	100

 

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Evaluación

Será preciso aprobar las pruebas escritas (E1) como requisito imprescindible para aprobar la asignatura.

Las pruebas escritas y las pruebas y trabajos experimentales serán recuperables. Para ello, en la recuperación se realizará una prueba escrita y otra prueba experimental en el laboratorio.

Sistema de evaluación	Ponderación	Recuperable
E1. Pruebas escritas	25 %	Sí
E3. Presentaciones orales	10 %	No
E5. Pruebas e informes de trabajo experimental (prácticas y trabajo)	60 %	Sí
E6. Participación activa	5 %	No

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Temario

La asignatura se centra en el estudio de los sistemas de información clínica, de historia clínica digital y de almacenamiento digital de imágenes médicas (PACS). Para ello se estudia la necesaria clasificación y representación de la información clínica mediante UMLS, CIE/ICD, CIAP o SNOMED CT. Se analiza la interoperabilidad de sistemas mediante el empleo de estándares de interconexión (HL7), estándares de intercambio de imágenes médicas (DICOM) y buses de servicio. Con todo lo anterior se trabaja el diseño, desarrollo y empleo de bases de datos en el ámbito socio-sanitario, hospitalario y asistencial. Finalmente, se diseña y desarrolla un sistema de información clínica en el laboratorio

 

Parte I: Introducción

Tema 1: Sistemas de información clínica

1.1.  Conceptos generales

1.2.  Subsistemas involucrados: bases de datos, análisis de datos, cuadros de mando.

1.3.  Tipos: sistemas de información clínica, de historia clínica digital y de almacenamiento digital de imágenes médicas (PACS).

1.4.  Interoperabilidad, interconectividad de sistemas. Red Sara.

1.5.  Protección de datos: RGPD + LOPD.

1.6.  Casos de estudio. Estudio del arte.

 

Tema 2: Bases de datos.

2.1.  Tipos de bases de datos.

2.2.  Modelo entidad-relación.

2.3.  Modelo relacional.

2.4.  Lenguaje SQL y gestor MySQL.

2.5.  Bases de datos biomédicas.

 

Parte II: Interoperabilidad

Tema 3: Estructuración de la información.

3.1.  Datos y metadatos: XML, JSON.

3.2.  Modelo dual: arquetipos y ontologías.

3.3.  Buses de servicio.

3.4.  Replicación de datos.

 

Tema 4: Clasificación y representación de la información clínica. Terminología.

4.1.  Estandarización.

4.2.  Unified Medical Language System (UMLS).

4.3.  Clasificación Internacional de Enfermedades (CIE/ICD).

4.4.  Clasificación Internacional de Atención Primaria (CIAP/ICPC)

4.5.  Sistema terminológico Snomed-CT.

4.6.  Logical Observation Identifiers Names and Codes (LOINC).

 

Tema 5: Estándares de comunicación.

5.1.  Health Level Seven (HL7).

5.2.  Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR).

5.3.  Digital Imaging and Communication On Medicine (DICOM).

 

Tema 6: Estándares de documentación.

6.1.  Clinical Document Architecture (CDA).

6.2.  Continuity of Care Record (CCR).

6.3.  Continuity of Care Document (CCD).

6.4.  Consolidated Clinical Document Arhitecture (CCDA).

6.5.  Open industry specifications, models and software for e-health (openEHR).

 

Parte III: Explotación de los sistemas de información clínica.

Tema 7: Explotación de los sistemas de información clínica.

7.1.  Data Analytics, Business Intelligence.

7.2.  Data Visualization.

7.3.  Automatización de alertas.

7.4.  Gestión sanitaria.

7.5.  Gestión de epidemias/pandemias.

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Programa de prácticas experimentales

Práctica 1: Introducción a los sistemas de información clínica.

Práctica 2: Base de datos relacional mediante MySQL.

Práctica 3: Interoperabilidad de datos: XML, JSON y buses de servicio (NextGenConnect).

Práctica 4: Definición de ontologías: WebProtégé

Práctica 5: Unified Medical Language System (UMLS): ICD/ICPC/Snomed-CT.

Práctica 6: HL7 y DICOM

Práctica 7: Instalación y parametrización de un sistema EMR y de un PACS.

Práctica 8: Herramientas de análisis de datos y Business Intelligence (BI).

Práctica 9: Minería de datos en sistemas de información médica.

 

Trabajo práctico: desarrollo de un sistema de información clínica en el laboratorio.

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Bibliografía

Acceda a la bibliografía que el profesorado de la asignatura ha solicitado a la Biblioteca.

T. Benson, Principles of Health Interoperability: SNOMED CT, HL7 and FHIR, Springer, 2016.

 

Oemig/Snelick: Healthcare Interoperability Standards Compliance Handbook: Conformance and Testing of Healthcare Data Exchange Standards, Springer, 2016.

 

A. Silberschatz, H. Korth, S. Sudarshan, Database System Concepts, McGraw Hill, 2010.

 

UMLS: https://www.nlm.nih.gov/research/umls/index.html

 

ICD-10: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/246208/9789241549165-V1-eng.pdf;sequence=1

 

SNOMED-CT

Gui¿a de Introduccio¿n a SNOMED CT, https://confluence.ihtsdotools.org/download/attachments/61154093/doc_Gui%CC%81adeIntroduccio%CC%81naSNOMEDCT_Current-es_INT_20180604.pdf?api=v2

Guía de subconjuntos SNOMED CT para el SNS. https://www.mscbs.gob.es/profesionales/hcdsns/areaRecursosSem/FactoriaDocs/GUIADESUBCONJUNTOS_HCDSNS2.pdf

SNOMED CT Starter Guide http://www.snomed.org/SNOMED/media/SNOMED/documents/doc_StarterGuide_Current-en-US_INT_20140731.pdf

 

LOINC

LOINC User¿s guide http://www.labdoc.it/osticket/documenti/LOINCManual.pdf

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Idiomas

Castellano

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