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Alejandro San Juan Ferrer es Diplomado en Magisterio (Especialista en Educación Física) por la Universidad Autónoma de Madrid, y Diplomado en Fisioterapia y Licenciado en Ciencias de la Actividad Física y el Deporte por la Universidad Europea de Madrid. Curso además el Máster en Alto Rendimiento Deportivo por la Universidad Autónoma de Madrid y el Comité Olímpico Español.
Realizó su doctorado en la Universidad Europea de Madrid dentro del programa "Actividad Física y Salud", donde estudió bajo la tutela del Dr. Alejandro Lucía y la Dra. Margarita Pérez, y defendió la tesis doctoral "Efectos de un programa de ejercicio supervisado intrahospitalario en pacientes pediátricos bajo tratamiento contra la leucemia linfoblástica aguda".
Ha trabajado como docente en diversos títulos de Grado, Post-Grado y Títulos Propios en diferentes universidades españolas, entre ellas la Universidad Complutense de Madrid, Universidad Autónoma de Madrid, Universidad Rey Juan Carlos, Universidad Europea de Madrid, Universidad Internacional de la Rioja. Desde el año 2012 trabaja en el Departamento de Ciencias de la Salud como profesor dentro del Grado de Fisioterapia en la Universidad Pública de Navarra.
Desde el año 2002 hasta la actualidad ha trabajado como re-adaptador físico y fisioterapeuta en el ámbito privado, siempre ligado a diferentes clubes, asociaciones deportivas y deportistas nacionales e internacionales (Baloncesto, Atletismo, Deportes de Invierno, Danza).
Durante este periodo formativo, profesional y docente, ha desarrollado su labor investigadora principalmente en el área de la fisiología del ejercicio clínica, estudiando los efectos de la actividad física en diferentes poblaciones y enfermedades, especialmente en relación al cáncer tanto en adultos como en niños. Además ha colaborado en el control fisiológico y la mejora del rendimiento de deportistas profesionales (Club Ciclista Banesto, miembros de las selecciones nacionales de atletismo de fondo de España, Eritrea, Marruecos).
Actualmente continua investigando en el campo del ejercicio y el cáncer, y también en relación a la fatiga y sus consecuencias en el aumento del riesgo de lesión.