Universidad Pública de Navarra - Nafarroako Univertsitate Publikoa
Universidad Pública de Navarra
Año Académico: 2023/2024
| Código: 740107 | Asignatura: Técnicas y avances en biología celular y molecular | ||||
| Créditos: 4 | Tipo: Optativa | Curso: 1 | Periodo: Anual | ||
| Departamento: Ciencias de la Salud | |||||
| Profesorado: | |||||
| URTASUN ALONSO, RAQUEL [Tutorías ] | ROTINEN DIAZ, MIRJA SOFIA [Tutorías ] | ||||
| ARAÑA CIORDIA, MIRIAM (Resp) [Tutorías ] | PAJARES VILLANDIEGO, MARIA JOSEFA [Tutorías ] | ||||
| GOÑI IRIGOYEN, SAIOA [Tutorías ] | FERNANDEZ IRIGOYEN, JOAQUIN [Tutorías ] | ||||
| SANTAMARIA MARTINEZ, ENRIQUE [Tutorías ] | SANTOS MARTIN, JOSE LUIS [Tutorías ] | ||||
Descripción/Contenidos
Conceptos básicos de ciencias -ómicas. Tecnologías de rutina e innovaciones disponibles. Ventajas e inconvenientes de cada técnica -ómica. Aplicaciones en Biomedicina. Microbiota. Análisis del microbioma. Nutrigenética y nutrigenómica. Técnicas de genómica, transcriptómica y epigenómica. Cultivo celular. Citometría de flujo. Amplificación y detección de ácidos nucleicos. Técnicas in situ de biología celular y molecular. Edición genómica.
Resultados aprendizaje
- RA 2. Reconocer y manejar conceptos, terminología, variables y herramientas propias de estudios de investigación en campos específicos de ciencias de la salud
- RA 22. Desplegar habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo
Metodología
| Actividad formativa | Horas Presenciales | Horas No presenciales |
| A-1 Clases teóricas | 18 | |
| A-2 Prácticas | 15 | |
| A-3 Debates, puestas en común, tutoría grupos | 6 | |
| A-4 Elaboración de trabajo | 6 | |
| A-5 Lecturas de material | 7 | |
| A-6 Estudio individual | 46 | |
| A-7 Tutorías | 1 | |
| A-8 Examen | 1 | |
| Total | 40 | 60 |
Evaluación
| Resultados de aprendizaje | Actividad de evaluación | Peso (%) | Carácter recuperable | Nota mínima requerida |
| RA 2, RA 22 | Examen teórico | 30 | Recuperable mediante prueba escrita | 5/10 |
| RA 2 | Exposición y defensa pública de un trabajo. | 22,5 | No recuperable | - |
| RA 2, RA 22 | Trabajo individual y/o casos | 47,5 | Recuperable mediante la entrega del trabajo corregido según indicaciones del profesor | - |
Temario
Bloque I. Ciencias ómicas en biomedicina
- Proteómica. Análisis de proteínas. Espectrometría de masas. Modificaciones postraduccionales. Motores de búsqueda y bases de datos. Ejemplos de aplicación.
- Lipidómica. Análisis de lípidos. Espectrometría de masas. Bases de datos. Ejemplos de aplicación.
- Interactómica. Interacciones funcionales y físicas. Generación e interpretación de redes moleculares asociadas a datos ómicos. Ejemplos de aplicación.
- Reposicionamiento de fármacos en base a huellas -ómicas. Ejemplos de aplicación.
- Microbiota. Microbioma. Métodos para el análisis del microbioma y su interpretación.
- Arquitectura genética de enfermedades relacionadas con la nutrición. Interacción genómica-ambiente. Diabetes tipo 1 y tipo 2. Obesidad. Dislipidemias.
Bloque II. Avances en biología celular y molecular
- Introducción a técnicas de Genómica, Transcriptómica y Epigenómica: WGS, WES, Microarray, RNA-Seq, scRNA-Seq, ChIP-Seq, ATAQ-Seq, Hi-C.
- Aplicaciones del cultivo celular: ensayo de citotoxicidad (MTS), detección de apoptosis, técnicas de transfección celular y preparación de células para análisis por citometría de flujo.
- Citometría de flujo: Conceptos básicos y aplicaciones en la clínica y en el laboratorio de investigación. Ejemplos y análisis.
- Últimos avances en amplificación y detección de ácidos nucleicos. Aplicaciones.
- Tendencias, aplicaciones y avances en técnicas in situ en Biología Celular y Molecular: técnicas inmunohistoquímicas multiplex, hibridación in situ (FISH, CISH, SISH...), técnicas transcriptómicas y proteómicas espaciales (DSP, HDST, Slide-Seq, FISSEQ, MERFISH, MALDI-MS, CODEX...).
- Edición genómica. Estrategias y herramientas. CRISPR/Cas9. Aplicaciones.
Programa de prácticas experimentales
PRÁCTICAS Y SEMINARIOS
- Bioinformática aplicada a un dataset ómico relevante en patología humana. Análisis de rutas metabólicas, complejos proteicos. Generación e interpretación de un interactoma molecular.
- Microbioma: casos prácticos.
- Nutrigenética: casos prácticos.
- Transfección de un plásmido en una línea celular. Análisis mediante técnicas de inmunofluorescencia, citometría de flujo y PCR a tiempo real.
- Diseño y análisis de un experimento de edición genómica con CRISPR/Cas9 in silico.
Bibliografía
Acceda a la bibliografía que el profesorado de la asignatura ha solicitado a la Biblioteca.
- Gómez Senent, S. (2022). Permeabilidad intestinal. Editorial Médica Panamericana (recurso Online Biblioteca UPNA).
- Beiko, R. G.; Hsiao, W.; Parkinson, J. (2018). Microbiome analysis, methods and protocols. Humana New York.
- Singh, S. (2020). Metagenomic Systems Biology: Integrative Analysis of the Microbiome. Springer Singapore (recurso Online Biblioteca UPNA).
- Tungland, B. (2018). Human microbiota in health and disease: from pathogenesis to therapy. Elsevier (recurso Online Biblioteca UPNA).
- Goetz, C. (2018). Flow Cytometry basics for the non-expert. Springer (recurso Online Biblioteca UPNA)
- Musunuru, K. (2021). Genome Editing. A Practical Guide to Research and Clinical Applications. Elsevier (recurso Online Biblioteca UPNA).
- Maresca, M.; Deswal, S. (2022). Genome Editing in Drug Discovery. John Wiley & Sons, Inc. (recurso Online Biblioteca UPNA).
- Biomarkers for Immunotherapy of Cancer. Methods and Protocols. Human Press. Editores: Magdalena Thurin, Alessandra Cesano, y Francesco M. Marincola. Methods in Molecular Biology. ISSN 1064-374.
- In Situ Hybridization Protocols (2021). Editorial: Springer US. Editores: Boye Schnack Nielsen, Julia Jones. ISBN: 9781071606254.
- Honglin Duan, Tao Cheng, and Hui Cheng. Spatially resolved transcriptomics: advances and applications. Blood Sci. 2023 Jan; 5(1): 1¿14.